分子軌道法を行うためのLinuxの導入　（あくまで参考です；　学生の頃は歯を折るほどプログラミングをギシギシやっていましたが、今はのんびりPCをやっています）
-　１つの目標は　Linuxで分子軌道法を動かす　-　（最終的には脱MS-Windows）

　　今や分子軌道法が手元にあるＰＣで計算できる！　40年前大学の時、大型コンピュータで精度の悪い分子軌道法 Extended Ｈｕｃｋeｌ method で計算していたのと比べてだいぶ進歩したのに驚いています。　付属研究所でやろうとしていた ＣＮＤＯ/ＭＩＮＤＯ での錯体分子の分子軌道計算ができるようになっている！　→　計算するために ＬＩＮＵＸ を使ってみようということから始めました。　Ｇｈｅｍｉｃａｌ でＰＣのディスプレーに分子を描いて回転させて眺める・・・そんなことから思いつくことがあります。　また、LINUX はほとんど英語の世界なので、この世界に入って何とか知ってやろうと思ってやっていたら英語力もｕｐするかもしれません。老輩の場合、老化防止になるかもしれません。
　　もしかして、このページを開けた人に化学企業で化学化合物の開発をやっている人がいた場合、化審法で生分解試験を予測するのにＭＯＰＡＣ計算を使えないか　という流れがあります（2000年代は話が盛り上がったようです）。ＭＯＰＡＣ の使い方を知って損はありません。化合物合成をトレースするには時間とテクニックが必要、合成方法について文書を読んでも間違いを指摘できるか微妙なことがあります。それらの点をカバーできるのがＭＯＰＡＣ等の分子軌道法による計算と考えられているようです。もちろんドラッグデザインの一方法としても使えます。
　　土器の焼成をＭＯＰＡＣで計算する詳細な方法については別頁に書きました。いろんな人が体験できるよう、MS−Windowsでできるよう、グラフィックツールはWINMOSTARを用い、MOPAC7をWINMOSTARから自動的に動かす方法を紹介しました。

１．システムの構築

　1-１．　Linux専用のPCを動かす
　　　本体５万円程度の安価なデスクトップＰＣを使う。理由は下記。
　　　　　MS-WindowsのvirusがPCに被害を及ぼすことを警戒する、その逆も真
　　　　　MS-Windowsのコマンドプロンプトで動かすというような安易な方向にに行かない（どうしてもMS-Windowsでやりたい人には合っているが）
　　　　　システムが問題なく動くようになった後はLINUXとMS-Windowsのデュアルブートにしてもいいが
　　　　　MS-Windowsのコマンドプロンプトで動かすと簡単なようで一方 path に問題あり（Winmostarを使い始めたら問題なく動きました。Winmostarの install は細かいところまでやってくれたようです。）
　　　　　　→　専用ＰＣとしてドスパラ製Regulus（CPU：AMD）を購入、ディスプレーは家庭用TV（単身赴任用）を使用（画像の質はやや悪く、PCを使う時はＴＶを見れないという欠点はありますが）
　　　　　　　　（20年前は自作ＰＣとして安価を売り言葉に販売していましたが最近は信頼性が充分になっているようです。１日に５時間以上　ひどい時は２0時間近く　２年以上使っていますがハード的なトラブルなし。）
　　　　　　→　当初、ビデオカードを入れないで使っていましたが（CPUに内蔵されているグラフィックdeviceでやっていた）、LinuxであるＵｂｕｎｔｕは動きませんでした（Dｅｂｉａｎは動きました）。問題があったようです。安価な（3000円台の汎用）ビデオカードを入れたらUBUNTUも動くなるようになりました。

　1-2..　ディストリビューションの選択
　　　ＯＳであるLinuxを簡単に動かすためのソフトをディストリビューションと言っている
　　　このことはOSであるＭＳ-ＤＯＳでＰＣを動かしているソフトであるMS-Windowsと同じ
　　　LINUXには数十のディストリビューションがある
　　　小輩はディストリビューションとして「ＤＥＢＩＡＮ」を選んだ、その理由は
　　　　　パケージ（簡単にインストールできるソフト）が豊富、設定に環境の規定が緩やか
　　　　　Puppyのような軽いﾃﾞｽﾄﾘﾋﾞｭｰｼｮﾝだとﾌﾘｰｽﾞ等が多く信頼性が低く、Ubuntuのような重いディストリビュ-ションだと設定に規定が多い（UEFI/ﾚｶﾞｼの問題）

　　　ﾃﾞｨｽﾄﾘﾋﾞｭｰｼｮﾝにUBUNTUがあります。UBUNTUをｲﾝｽﾄｰﾙして使ってみましたが、分子軌道法（MOPAC）の入出力を行うためのグラフィックツールがうまく動かない、ﾊﾟｯｹｰｼﾞに分子軌道法関連のソフトが少ない　という問題があり、インストール後１週間でアンインストールしました。何回かＵｂｕｎｔｕ ⇔ Ｄｅｂｉａｎ の ｉｎｓｔａｌｌ / uninstall をやっていますがＵｂｕｎｔｕでは思っているようには動きませんでした。分子軌道法を使わなければＵｂｕｎｔｕはいいのですが、小輩のように分子軌道法メインだとあっていません。Ｕｂｕｎｔｕで問題なく動くグラフィックツールを探せばいいのかもしれませんが。（Ｌｉｎｕｘの表計算/ﾜｰﾌﾟﾛ/ﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽ/日本語変換 ソフトはMS-Windowsのｿﾌﾄを使い慣れすぎている小輩にとって機能がかなり劣っています。蛇足ですが、MS-Windowsの日本語変換ソフトIMEは旧ＡＩｿﾌﾄ社のＡ-WAORDのWXｿﾌﾄを買収したものという噂を聞いたことがあります。いたれりつくせりのｺﾝﾊﾟｸﾄなｿﾌﾄでした。MS社は３Ｋ社の「松」やJust Systems社の「一太郎」の技術ではなくAI社のWXを評価したと想像しています。）
　　　2017/4時点で、Ｌｉｎｕｘ PCはDｅｂｉａｎとＵｂｕｎｔｕのデュアルブートにしていて、時々Ｕｂｕｎｔｕを動かしています。Ubuntuを使っていると、バックグラウンドで処理をしていることがあって動作が極端に遅くなることがあります。Ｄｅｂｉａｎではそのようなことがない。分子軌道法のような計算をやるにはＤｅｂｉａｎがあっていると思っています。Ｄｅｂｉａｎｍｐ悪い所は周辺機器との接続が悪い点と遊びｿﾌﾄが比較的少ない点。それらを重視したらＵｂｕｎｔｕがいいかもしれません。小輩、ｽｷｬﾅ/ﾌﾟﾘﾝﾀはＤｅｂｉａｎで設定していません。ＤｅｂｉａｎとＵｂｕｎｔｕでデータを共有化できるので問題なしと思っています（ｽｰﾊﾟｰﾕｰｻﾞｰの権限が必要ですが）。
　　　Debianもversionによって使いたいソフトがﾊﾟｯｹｰｼﾞにないといったことがあって、小輩がたまたま使ったversionが良かったということがありました。小輩が使っているのはversion7.8.0
　　　ﾊﾟｯｹｰｼﾞとして「synaptic」をインストールして使えばＵＢＵＮＴＵでも異なるversionのDebianでもｲﾝｽﾄｰﾙできることがわかりましたが、ＵＢＵＮＴＵではインストールしたソフトが動かないという結果でした。

　1-3..　セキュリティ
　　　インストール時に暗号化することを勧めます。選択で暗号化をインストールできるようになっています。
　　　Ｄｅｂｉａｎが勧めるファイアウォールの設定も一応必要です。Linuxは簡単には侵入できないようになっていますが、小輩はソフトｕｎｆｗを使っています。
　　　リナクッスには多くのセキュリティ方法があります（ﾏﾆｱｯｸなﾚﾍﾞﾙまであります）。納得のいくレベルまでやってください。
　　　小輩は分子軌道法に関係するソフトだけリナックスのＰＣにダウンロードするようにしています。　　　使い始めて2年たち分子軌道法で一段作就いたのでいくつかのソフトを試しています。
　　　メールをリナックスＰＣで開けることもありますが、原則として読むたけ。送信するときは書式をテキストとして送っています。

　1-４..　グラフィックツールにGhemicalを選択
　　　MOPAC等の量子化学計算ソフトは計算だけで座標入力、計算結果にグラフィック表示ができない
　　　GhemicalはMOPAC等の入力/出力ﾂｰﾙとして使える
　　　半経験的分子軌道法だけでなく、ab initio、量子力学の入出力ができる
　　　設定が容易
　　　コマンドが直感的でマニュアルをそれほど読まなくても動かせる。
　　　但し、バグがあって、それが長年修正されていないようで限界の可能性あり、限界に遭遇した場合、他のツールを探す
　　　（多種のソフトに対応できるよう種々出力フォーマットが用意されているが、フォーマット選択に手間がかかっている → 小輩の場合MOPACのフォーマットだけが必要なので、機能を小さくすることを検討中：ソフトをいじれる楽しみがLinuxにあります；小輩、大学時代はFortranでプログラミングをすることが遊びでした。企業に就職後、種々ソフトのマクロ/ＶＢＳ/ＳＱＬ/Basicをやることが普通の人がゲームをやるのと同じ遊びでいましたが）
　　　2017/4の時点ではＧｅｍｉｃａｌに限界を感じていませんが、フリーウェアAbogadroをインストールして時々使っています。使い勝手はまあまあ。いい点があれば乗り換えるかもしれません。また、ビュアーに見栄えがいいのがありますが、計算結果の数値に関心があるので使おうとは思わない段階です。

　1-５.　分子軌道法としてＭＯＰＡＣ７を選択
　　　初級レベルでは一昔前の半経験的分子軌道法のＡＭ１/ＰＭ３で充分
　　　free wareのMＯPAC7はAM1/MIND0/PM3ができる　（MOPACではMINDOはMNDOと"Ｉ"がない形で使われています）
　　　研究が進み、ＭＯＰＡＣ7が不充分と考えられた場合、有償MOPACやab initio、高速PCを用いればいい

　1-６.　分子軌道法を何に役立てる？
　　　（ここからが個人/学校/企業の創造力/判断）
　　　土器づくりで分子軌道法を使うことを考えると、焼成温度と焼成時間の関係。粘土の代表的成分・長石の脱水反応を計算する？　こんな風に分子軌道法を考えています。
　　　小輩の興味は計算の結果ではなく、プログラミング。グラフィックソフトや分子軌道法ソフトを改良することなので、そちらに向かいと思います。普通の人は結果に興味があると思うので、面白い結果を出すこともやります。だれも関心を持たないことをやっても仕方がないので。

2.　個々ソフトのインスト-ル

　2-1　Debianのinstall
　　　MS-Windowsで動いているＰＣにDebian install用ＣＤをセットするﾞ
　　　CDにinstall用Debianを焼き付ける
　　　PCのbootをCD立上げにしてPCを立ち上げる　（Debianの場合、リガシーで可能）

　　　　ＨＤのうちDebian （ＬＩＮＵＸ）領域を設定する（全域をLinuxにすることを勧める；一般的Debian説明には別のｿﾌﾄで領域確保を勧めている）
　　　　installが終了したら、Ｄｅｂｉａｎの諸機能が使えるようになっていることを確認

　2-2　Ghemicalのinstall
　　　DebianのﾊﾟｯｹｰｼﾞにGhemicalがあることを確認
　　　Ghemicalのﾊﾟｯｹｰｼﾞをinstallする（関連ｿﾌﾄが同時にinstallされる）

　2-3　M0PAC7のinstall
　　　DebianｖのﾊﾟｯｹｰｼﾞにMＯPAC7があることを確認
　　　Mopac7のﾊﾟｯｹｰｼﾞをinstallする（関連ｿﾌﾄが同時にinstallされる）


3.　Ｇｅｍｉｃａｌの使い方

　3.1.　Ghemicalの日本語マニュアル　
　　　Ghemicalのﾕｰｻﾞｰﾏﾆｭｱﾙの日本語訳を示します　（直訳的なので簡単ﾏﾆｭｱﾙはここをクリック）
　　　（あくまで参考です。ＷＯＲＤ等に貼り付けて、画像を原本からコピーして、間違えなどを修正して使ってください。）
　　　（原本はGhemicalの"ﾊﾟｯｹｰｼﾞ"に入っています。）
　　　（小輩のPCの場合、ﾌｧｲﾙのｼｽﾃﾑ/usr/share/ghemical/3.0.0/user-docs htmlにinstallされていました。但し、ver.2.00のﾏﾆｭｱﾙでした）


4.　ＭＯＰＡＣ７の使い方

　4-1　ＭＯＰＡＣ７の入力方法

　　4-1-1. キーワードの入力:Z-matrix入力欄の上３行の第１行目
　　　　　1) M0PAC7の機能のどれで計算するかを指定する。例えばｷｰﾜｰﾄﾞ「PM3」でPM3のﾊﾐﾙﾄﾆｱﾝを使う。
　　　　　2) 複数のｷｰﾜｰﾄﾞは空白で区切る
　　　　　3) 大文字/小文字はどちらでも機能は同じ
　　　　　4) １行で収まらない時は、最終文字を″十″とすることで次行がｷｰﾜｰﾄﾞ行になる
　　　　　5) ｷｰﾜｰﾄﾞの使用方法はマニュアル/使用例を参考にして試行錯誤する
　　　　　6) よく使用されるｷｰﾜｰﾄﾞ
　　　　　　　　PM3              ﾊﾐﾙﾄﾝとしてPM3と指定（MOPAC7ではAM1、MINDO/3、PM3がﾊﾐﾙﾄﾝとして使える）
　　　　　　　　PRECISE        SCF終息の閾値を小さくして計算する
　　　　　　　　SYMMETRY   原子間距離/結合角/二面角について対象に計算（項目6に独立項として記述）
　　　　　　　　FORCE          振動計算を行い遷移状態をﾁｪｯｸする。結果をxyz方向の振動数の値として出力
　　　　　　　　TS                ﾐﾆﾏﾑｴﾈﾙｷﾞﾊﾟｽで概算し、概算値を初期値としてこのｷｰﾜｰﾄﾞで遷移状態を求める
　　　　　　　　SADDLE         遷移状態を探索するための初期構造を探す。SADDLE計算に用いる2つのZ-matrixは同じ順序/同じ結合様式でなくてはならない。「SADDLE」と「xyz」を併用するのが一般的
　　　　　　　　VECTORS　　　最終固有ベクトルを表示する　（ある固有エネルギにおける電子密度の分布の表示 ； ハートレーマトリックス行列の解であるベクトル）
　　　　　　　　BONDS　　　　　最終結合度マトリックスを表示する　（各原子間の電子密度を表すマトリックス）

　　4-1-2. コメントの入力:Z-matrix入力欄の上３行の第2、3行目
　　　　　1) M0PAC7の機能に影響することはない
　　　　　2) 計算内容を表す記述をする

　　4-1-3.　分子構造座標等の入力：　
　　　　内部座標で入力　（ｶｰﾃｼｱﾝ座標（xyz）で入力することもできるが、その方がかえって難しい）
　　　　元素名/座標/ﾌﾗｯｸﾞ/結合関係を示す配列を Z-matrix と呼んでいる。
　　　　下に示すのはMOPAC様式の Z-matrix。　例えば、GAMESSにはGAMESS様式の Z-matrix がある。

　　　.　　1）　 Z-matrix例（例は判りやすいように揃えているが、入力ﾃﾞｰﾀは空白で区切られている（Tabではだめ）だけで機能する）　


　　　　　2) 原子の番号と結合距離/結合角/二面角の入力
　　　　　　　�@ 反応の中心などの原子を１番にする
　　　　　　　�A 結合している骨格の一員になる原子を２番にし、原子間の距離をÅで入力する
　　　　　　　�B 原子の番号２と結合している原子の番号を３とし、２との距離、3-2-1の結合角を入力する
　　　　　　　�C ４番以降は当該原子-N1の距離、当該原子-N1-N2の結合角、当該原子-N1-N2-N3が作る二面角を入力する

　　　　　3) 元素名
　　　　　　　�@ M0PAC7が各ﾊﾐﾙﾄﾆｱﾝでﾊﾟﾗﾒｰﾀを用意している元素の名称を入力する。
　　　　　　　�A 計算上、原子の座標に問題がある場合、ダミー原子（Ｘ）を入力する時がある。

　　　　　4) FL :　最適化ﾌﾗｯｸﾞ、下記の数値のどれかを入力する.。
　　　　　　　　　　構造最適化の時は分子の対称性を考慮した上で”1”を多用するが、遷移状態で計算する時は構造を変えないモイエティは最適化ﾌﾗｯｸﾞを”0”にするなど、最適化フラッグをどうするか熟慮する。
　　　　　　　�@ ＝1　:　最適化する
　　　　　　　�A ＝O　:　最適化しない
　　　　　　　�B ＝−1:　ﾐﾆﾏﾑｴﾈﾙｷﾞｰﾊﾟｽの計算を行なう

　　　　　5) N1、N2、N3 : 当該原子番号以前の番号を参照する
　　　　　　　�@ N1 : 結合距離の対象になった原子の番号
　　　　　　　�A N2 : 結合角の対象になった原子の番号
　　　　　　　�B N3 : 二面角の対象になった原子の番号

　　4-2. ﾐﾆﾏﾑｴﾈﾙｷﾞｰﾊﾟｽ計算の距離変数値の入力等:Z-matrix入力欄の下に行を入力する
　　　　　1) 遷移状態を探索する際に距離ﾌﾗｯｸﾞを-1にして複数の原子間距離を入力する
　　　　　2）　　　〃　　　　　　　　　　　二面角ﾌﾗｯｸﾞを-1にして複数の角度を入力する

　　4-3　ｷｰﾜｰﾄﾞ　「SYMMETRY」　の使い方
　　　4-3-1.　説明
　　　　　SYMMETRYデータはZ-matricsの後に置かれる。もしミニマムエネルギの反応座標やSADDLEの第２データのような
　　　　　他のデータがある場合、SYMMETRYのデータはそれらの後に置く。
　　　　　SYMMETRYのデータの並べ方は次のようである
　　　　　　　　指定原子、　SYMMETRY関係、　指定原子、　指定原子、　指定原子、　指定原子、　・‥

SYMMETRY関係　　　　SYMMETRY機能

　　　　　上記関係のうち1、2、3、14が良く使われる
　　　　　SYMMETRYを使う時はカーテシアン座標を使わない
　　　　　関係18はポリマーで使うために作られたもの

　　　4-3-2.　SYMMETRYの例
　　　　　エタンを例としてSYMMETRYをキーワードににした場合の入力方法を示す

　　　　　SYMMETRY
　　　　　Ethan、D3D

　　　　　3　1　4　5　6　7　8
　　　　　3　2　4　5　6　7　8

　　　　解説： �@原子の番号３と同結合距離を原子の番号4,5,6,7,8、の原子に設定する
　　　　　　　　�A原子の番号３と同結合角を原子の番号4,5,6,7,8、の原子に設定する
　　　　　　　　�B原子の番号4,5,6,7,8の原子の結合距離/結合角/二面角は変えない

　　4-4　ｷｰﾜｰﾄﾞ　「SADDLE」　の使い方
　　　　PM3/AM1/MNDOについてSADDLEで遷移状態を探した。

　　　　UHF GEO-OK SADDLE
　　　　ﾗｼﾞｶﾙ引抜反応

　　4-5　ｷｰﾜｰﾄﾞ　「TS」　の使い方

　　SYMMETRY UHF GEO-OK TS
　　ﾗｼﾞｶﾙ引抜反応

3　1　4　5
3　2　4　5　6


　　4-6　ｷｰﾜｰﾄﾞ　「FORCE」　の使い方
　　　TSで得られた遷移状態で振動を求める。虚の振動を示せば遷移状態

　　　SYMMETRY UHF GEO-OK FORCE
　　　ﾗｼﾞｶﾙ引抜反応

　3　1　4　5　6
　3　2　4　5　6

　　虚の振動ﾓｰﾄﾞが１つ(2402i cm-l)得られた　→　遷移状態と判断できる
ROOT NO. 　1 　　　2 　　　3 　　　4 　　　5 　　　　6 　　　7　　　 8 　　　　9 　　10
　　　　　　-2402 　481　 481　 1167　 1167　 1413　 1431　 1431　 1611　 3326

5.　GhemicalとＭＯＰＡＣのデータ交換

　5-1.　Ghemical→MOPAC
　　　0)　Debianﾃﾞｽｸﾄｯﾌﾟの左上にある「ｱﾌﾟﾘｹｰｼｮﾝ」でｸﾘｯｸ、ｱﾌﾟﾘｹｰｼｮﾝの分類のﾘｽﾄが表れる。
　　　　　ﾎﾟｲﾝﾀを「科学」に置くとｲﾝﾝｽﾄｰﾙされているｿﾌﾄのﾘｽﾄが表れる。「gemical」をｸﾘｯｸ。Ghemicalの画面が表れる。
　　　1)　画面上で分子を組み立て(Ghemicalマニュアル参照)る。簡便な構造最適化を行なう(分子力学法)
　　　2)　右クリックでﾘｽﾄが表れるので「File」にﾎﾟｲﾝﾀすると右にﾘｽﾄが表れる。
　　　　　そのﾘｽﾄから「Export」をｸﾘｯｸ、ﾌｧｲﾙ書式から｢MOPAC internal｣をｸﾘｯｸ、化合物名を入力してＯＫをｸﾘｯｸする。
　　　3)　Ghemicalを閉じる(ＭＯＰＡＣ様式Z-matrixがﾌｧｲﾙに保存された)。
　　　4)　ﾃﾞｨｽｸﾄｯﾌﾟの左上にある「場所」をｸﾘｯｸ、ﾃﾞｨﾚｸﾄﾘの内容を表すWindowが開く。
　　　　　小輩の設定だとﾃﾞｨﾚｸﾄﾘ「ホーム」にﾌｧｲﾙFOR005が保存されている。
　　　　　ＭＯＰＡＣ７入力ファイル“FOR005”に2)で得られたZ-matrixをコピー
　　　5)　 Z-matrixの前にｷｰﾜｰﾄﾞ/ｺﾒﾝﾄを入力、後にpoint値(変化値)を入力しで"FOR005”を保存

　5-2. M0PAC7処理
　　　0） ﾃﾞｽｸﾄｯﾌﾟの左上にある「ｱﾌﾟﾘｹｰｼｮﾝ」をｸﾘｯｸ。
　　　　　ﾎﾟｲﾝﾀを「ｱｸｾｻﾘ」に置くとﾘｽﾄが表れて「端末」をｸﾘｯｸ。ｺﾏﾝﾄﾞﾌﾟﾛﾝﾌﾟﾄの画面が表れる。
　　　1)　 「/usr/lib/mopac7/mopac7 >FOR006」を入力することでＭＯＰＡＣ７が起動。
　　　　　F0R005に入力された化合物についてｷｰﾜｰﾄﾞで入力した計算を開始
　　　　　(小輩がＭＯＰＡＣ７をinstallしたｹｰｽではＭＯＰAC7起動コマンドはﾃﾞｨﾚｸﾄﾘ｢/ｕsｒ/lib/ｍｏｐａｃ７/｣になり、ﾌｧｲﾙ
　　　　　｢F0R005｣はﾃﾞｨﾚｸﾄﾘ｢ホーム｣にあった。　ﾃﾞｨﾚｸﾄﾘ｢ホーム｣はﾕｰｻﾞｰﾃﾞｨﾚｸﾄﾘのrootﾃﾞｨﾚｸﾄﾘ)。
　　　2） MOPAC7では入出力ファイルのファイル名を次の様に既定している。
　　　　　
　　　3)　問題がなければプログラム終了。エラーが出たら対処する。
　　　4)　 F0R005が保存されていたﾃﾞｨﾚｸﾄﾘと同じﾃﾞｨﾚｸﾄﾘに計算結果としてﾌｧｲﾙFOR006/FOR009/FOR010/FOR011/FOR012に出力される。
　　　5)　ＭＯＰＡＣ７を終了する
　　　6)　FOR006のﾌｧｲﾙ名を計算内容に変更して関係ﾌｧｲﾙが保存されているﾃﾞｨﾚｸﾄﾘに移動して保存する。
　　　　　(ＭＯＰＡＣでは入力ﾌｧｲﾙ/出力ﾌｧｲﾙの名前をFOR005〜FOR012に決めて使っている)
　　　　　(入力用/出力用ｱﾌﾟﾘｹｰｼｮﾝ(小さいプログラム)を作って作業を簡単にすることができるがここでは基本的な使い方を述べる)

　5-3. MOPAC→　Ghemical
　　　1)　 Ghemicalを起動する。
　　　2)　項目2.6)で作成したファイルをインポートする(左ｸﾘｯｸ､ﾌｧｲﾙ→ｲﾝﾎﾟｰﾄｸﾘｯｸ、「MOPAC internal」を ｸﾘｯｸ)
　　　3)　ｲ匕合物の画像を眺める


9.　参考文献/URL

　MOPAC7を使い始める時には　4）、101） が役に立ちました。　103) はちょっとしたテクニックを知ることができました。

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　以　上

【参考】 ； ghemical と MOPAC7の使い方例です。　ＨＯＭＯ、ＬＩＭＯを見るのが本来の分子軌道法ですが、参考まで。

土器焼成のＭＯＰＡＣ計算

やや大きい分子の計算例

共重合の計算で得られること／限界

ALの定着性　固有ベクトル計算結果を見て考える、　土器づくり/陶芸をする時に白い衣服はご注意を

結合の強さを調べる

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