だと思います。

それに
「敵役にもいろいろあって
悪の一言では片づけられないんだ…」
とかいったストーリーにも、そこにこだわるあまり
意味不明かつ内容薄弱になっているものも多い気も…

勧善懲悪は物語の王道と言えるかもしれませんが、
そうだとしても、薄っぺらいと同義語ではないと思います。

僕は勧善懲悪は結構好きなストーリーです。
思いっきり狙いまくった悪が主人公のストーリーも好きですが。