本作の最難関である、いわゆる「三犬」たちの捕獲に挑む。
本作における徘徊ポケモンの捕獲が特に難しいといわれる理由。
なんといってもこれが一番辛い。三犬全てが使用する（クリスタル版の固定エンカウントのスイクンは使わない）。
黒い眼差しで逃走を封じ、眠らせることに成功しても、起き抜けに25％の確率で吠えられてしまう。
唯一の救いは、当時の強制交代は必中ではないこと。影分身を積んだり、光の粉を持たせることで回避の可能性がある。
第三世代以降は「リピートボール」「タイマーボール」という汎用的かつ強力なボールがあるが、本作では事実上ハイパーボールしか選択肢が無い。
こちらのLvが82以上ならレベルボールも有効だが、大量入手に難がある上に、先頭のポケモンをLv41以上にしてしまうとスプレーによる絞り込みが不可能になる。
またスピードボールは彼らには効果がない（参考）。
後の世代では、各種配布や連動ソフトによって確実な入手が可能になる例も多いのだが、
第二世代においてそのような救済手段は存在しない。ガチ捕獲あるのみである。
クリスタル版にてスイクンが固定エンカウントになったが、いずれにせよライコウとエンテイは徘徊のみ。
眠りなどで行動不能になっている場合は、黒い眼差しの有無に関わらず逃げることはない。
（当たり前と思われるかも知れないが、第三世代以降は当然のように逃げ出したりする）
本作において「逃げる」という行動は技の効果を置換して行っている模様。
なので黒い眼差しを先制で仕掛けたターンでも何らかの技を使う。ここで吠えられたらおしまい。
さらに厄介なことに、ライコウは電光石火を覚えている。逃走を封じていない状態でこの技が選ばれた場合、優先度+1で逃げてしまう。
つまり、素早さがいくら高くても1ターン目に先制で逃げられてしまうことがある。
ライコウに関しては他の2体より厳しいので、いっそマスターボールを使ってしまうのも手。
現在HPは再遭遇時も維持される。つまり与えたダメージがそのまま残る。
しかしPPに関しては戦闘ごとに初期化される模様（吠えられた後に捕獲すればわかるはず）。
このため、何度も戦闘を繰り返したとしても悪あがきによる自滅を心配する必要はない。
バグにより、三犬に与えたダメージを引き継いだ一般野生ポケモンが出現することがある。
恐らくは何らかのフラグの異常によるもので、これを捕まえたり倒したりすると対応する三犬が消滅する可能性がある。
あまり見られない現象だが注意しておきたい。不安なら見た時点でリセットするのも手。
お手軽に済ませるならルージュラ、理想的にはドーブルがおすすめ。それぞれ一長一短がある。
逃走を封じる黒い眼差し、眠らせる（行動を抑制し捕獲率を向上させる）悪魔のキッスを自力で覚え、
前作技マシンで確実にHPを削る地球投げ（固定ダメージ）を覚え、回避率を高めて吠えるを防ぐ影分身の技マシンも安く買える。
逆に言えば、前作に送る手段がないと固定ダメージ技を覚えないので、適当な技で削るしかなくなるのが難点。
地球投げを3発当てて120ダメージを与えればちょうどよく削ることができる。
最もHPが低いライコウでも最低122はあるので倒してしまうことはない。
逆に、HPの高いエンテイだと最高で34/154まで残ってしまうが、それでも捕獲率は上限に達する模様。
なぜなら計算式の都合上、被捕獲度が極端に低いとダメージを極限まで減らさなくても捕獲率が上がりきってしまうのだ。
（具体的には、およそ1/3以下にすればそれで十分の模様）
パラメータに関しては、「個体値*2+努力Lv」を45にすれば、Lv40時点で素早さ99を達成可能。
レギュラーバッジの補正によって1.125倍されて111になるので、最速のライコウにも先制可能な計算になる。
個体値が最大の15なら努力Lvは15でいい。インドメタシンを2個で足りる。
個体値が低い場合でもドーピング+αで問題なく達成可能。
さらに、ライコウをマスターボールで捕獲するなら素早さを気にする必要はなくなる。
赤緑ならイベント交換（まさこ）で手に入るので容易に厳選できるという意味でも手軽。
黒い眼差しは金銀Lv35で覚えるので、初代ではLv34以下に抑えておく必要がある点だけは注意。
あらゆる技を覚えることができるので、まずキノコの胞子で確実に眠らせることができる。
ルージュラを使っていると悪魔のキッスが外れて悔しい思いをすることもあるが、ドーブルならその心配はない。
もちろん逃走防止の黒い眼差しも覚えられるし、回避率アップ（吠える対策）の影分身も覚える。
（念の為補足するが、小さくなるが回避2段階アップになったのは第五世代からである。PPは多いが踏みつけダメージ倍増のペナルティの分だけ損）
峰打ちではダメージが小さすぎる上、前述のようにHP1まで減らす意味はないので、ルージュラ同様に固定ダメージ技を使おう。
地球投げorナイトヘッドor竜の怒り、どれでも構わない。
難点はパラメータの低さ。まずライコウに先制するにはバッジ補正込みで実数値98、つまり「努力レベル + 個体値*2」が82以上必要。
耐久力強化も兼ねてしっかり努力値を入れておきたい。手間はかかるが、周回プレイで何度も捕まえる予定ならそれに見合った価値がある。
また、Lv40で4つの技を揃えるならタマゴからLv5を育てなければならない。スケッチに関してはこちらも参照。
ルージュラにしてもドーブルにしても、倒されてしまったら次のターンに逃げられてしまう。
そのため、高レベルで黒い眼差し（クモの巣）とキノコの胞子を覚えた汎用捕獲要員のドーブルがいると万全。
Lv40弱のビリリダマやマルマインを先頭にして、先制自爆によるターンカットからの死に出しで高Lvドーブルを出すという手がある。
初代の無人発電所なら固定エンカウントでLv40ビリリダマを手軽に調達できる。
専用の捕獲要員を用意しなくてもよい一方、ライコウに先制逃げのチャンスを2回も与えてしまう。
さらにライコウに関してはビリリダマの自爆でも急所に当たれば倒れてしまうこともあるので不向きか。
久しぶりに金銀をプレイする場合、意外と忘れがちなのがこれ。
まず、焼けた塔の奥の穴から最深部に入り、彼らの封印を解かなければならない。
厳選目的でもない限り、エンジュに着いたら忘れずにやっておこう。冒険中に偶然遭遇することもあり得る。
（余談だが、このときのフィールド上のグラフィックである汎用四足獣アイコンこそが「三犬」の由来である）
奥に入るためには入口から左回りで先に進む。ここで「岩砕き」が必要。
技マシンはウソッキーとの戦闘後、キキョウ西の道路にいる太った男からもらえる。
コガネ百貨店でも買えるが、イベントでもらっておかないと陳列されないので要注意。
シナリオ進行に必須のイベントになった。そのかわり岩砕きは不要に。
ライバルとの戦闘後に穴に落ちる必要がある。
戦闘後に穴抜けのヒモ等で脱出したり、セーブを挟むことは可能。
このイベントをこなすまではマツバと戦えない。つまり波乗りも空を飛ぶも使えない。
よって、厳選作業は金銀の場合よりもかなり不利になることに気を付けよう。
スイクンについてはその後のイベントで固定エンカウントなので、スイクン厳選ならばクリスタル版一択である。
イベント後、彼らはジョウト地方を縦横無尽に駆け回る。
この時点ではまだ図鑑に登録されないので、まずは遭遇しておかないと追跡できない。
イベント終了直後は周辺の草むらにいる（各々がどちら側に向かうかはランダム）ので、若干遭遇しやすくはなっている。
主人公がエリア移動（ゲートや建物への出入りを含む）するたびに、彼らも1手移動する。
基本的に隣接する道路に移動するが、町はスルーする。つまり町を挟んだ道路には1手で移動されてしまう。
通信交換やトレーナーハウスでの戦闘（←不思議な贈り物）によって図鑑登録した場合でも捕捉は可能になるので、その場合はこの項目を読む必要はない。
まず用意するのはLv40のポケモン。先頭においてスプレーを使えばLv39までの野生ポケモンを抑制できる。
つまり、Lv40の三犬以外のポケモンとのエンカウントをカットすることができる。
遭遇するだけなら何でもいいが、ついでに捕獲を試みたほうがいいのは言うまでもないので先述のルージュラを用意しよう。
おすすめポイントはエンジュシティ西の38番道路。
ゲートが近い上に、横に長い草むらで左右のキーを押すだけでいいのが特徴。
邂逅直後に穴抜けの紐を使い、すぐに向った場合でも位置が重なる可能性がある。
三犬はこちらがエリア移動（地図上の地形が同じゲートへの出入りも含む）すると移動する。
このとき主人公の位置をある程度捕捉しているようで「2回前まで主人公がいたところ」には絶対に立ち寄らない。
つまり、2エリアを延々と往復するだけでは絶対に遭遇できないようになっている。
このため「38番道路（屋外）→38番道路（ゲート）→エンジュシティ→38番道路（ゲート）→38番道路（屋外）」と移動するのがよい。
（要は、ゲートに入ったら右押しっぱなしでエンジュまで戻ればいいということ）
これなら、38番道路（屋外）に出た時点で三犬に遭遇する可能性が常にある。
細長い草むらを3往復くらいして、遭遇しなかったらエンジュシティまで戻って繰り返そう。
ちなみに余計なトレーナー戦でルージュラに経験値が入ってしまっても、育て屋に預ければリセットできるので気にする必要はない。
一旦図鑑に表示されるようになればあとは追いかけるだけ。
しかしこちらの移動に対応して奴らは動く。町から出るのにゲートを挟んだりすると2回分移動する。
よって、ゲートを挟まずに草むらのあるエリアに移動できる町を拠点にしたい。
さらにランダムでワープしてしまうこともあるので完全に追跡することはできない。
「空を飛ぶ」を使うことで、奴らの座標をリセットすることができる。
つまり、町の近くに来るまで繰り返せば良い。
（ちなみにロードするたびに位置が変わるのでソフトリセットでも良いが、図鑑のカーソルが初期化されてしまうのでおすすめしない）
ヒント：図鑑は上下キーで前後のポケモンに切り替えられる
おすすめの拠点はキキョウシティである。
キキョウシティは東西南の三叉路に位置している上に、西と南にはゲート無しで抜けられるので捕捉しやすい。
エンジュやチョウジでも同様なのだが、草むらへのアクセスが面倒（波乗りが必要）なのでおすすめしない。
キキョウシティに空を飛ぶで移動した時に次手で遭遇できる可能性について、以下の画像を参考に説明する。
| 地名 | 解説 | |
|---|---|---|
| 1 | 31番道路 | キキョウに隣接（ゲートあり）。次に2か4に移動する可能性がある。 |
| 2 | 32番道路 | キキョウに隣接。次に1か4に移動する可能性がある。 |
| 3 | 35番道路 | 次に4に移動する可能性がある。 |
| 4 | 36番道路 | キキョウに隣接。次に2に移動する可能性がある。 |
| 5 | 37番道路 | 次に4に移動する可能性がある。 |
主人公がキキョウシティにいる場合、以上のいずれかに三犬がいるなら次の移動で捕捉できるチャンスがある。
「次に移動する可能性がある場所」に先回りすれば、運が良ければ重なることができる。
反対側など、上記で挙げた場所以外にも移動する可能性があるが、キキョウからでは追いつかないので省略している。
キキョウシティにいる時に建物（ポケモンセンターでも可）に出入りすることで三犬は2手分移動する。
1〜5の近くにいる場合、空を飛ぶでリセットするよりも手っ取り早く寄せられる可能性がある。
見当違いの方向に移動してしまった場合は素直に空を飛んだほうがよいだろう。
注意点として、キキョウから隣接しているのは1，2，4のポイントのみで、なおかつ1はゲートを挟むので主人公は1手で移動することができない
（三犬は、ゲートの有無に関係なく地形を移動できる）。
三犬が4にいる場合、次に1，3，5に移動する可能性もあるが、主人公がキキョウにいる状態からは1手では行けない（よって消去法で2を目指す）。
追跡する場合、前述の「2回前まで主人公がいたところ」には絶対に立ち寄らないというのを忘れずに。
また、他の野生のポケモンと戦闘すると移動してしまう場合がある。スプレーが使えない場合はさらに遭遇が難しくなる。
光の粉
ルージュラ/ドーブルの持ち物。気休め程度だが吠えるの被弾率を下げる。
入手には前作との通信が必須なので、なければ食べ残しも効果的（回復の手間を省ける）。
ヨクアタール
金銀でも1個使えば必中になる。ドーブルなら不要だが、ルージュラなら2回目の悪魔のキッスを必中化。数個は持っておこう。
ボール
できればハイパーボールがいいが、モンスターボールでも確率に大差はない。とにかく数を揃えるのが大事。
なお眠りかつHPを減らしていれば、ハイパーボールで6.25％、モンスターボールで約5％のようだ。
ゴールドスプレー
何度も使うことになるので効果時間の長いゴールドを。リセット前提でも10個は欲しい。
HP回復アイテム
ルージュラの場合、特にエンテイの火の粉が痛い。
PP回復アイテム
戦闘が長引いたときや、連チャンで2匹目が同エリアに出現した場合に備えて。
状態回復アイテム
電気ショックや火の粉の追加効果リカバリーとして。回復の薬でもいい。
ルージュラの場合、遭遇したらまずは黒い眼差し。
吠えるを使うのは25％であり、さらに光の粉で回避する可能性もあるのでこれが最善。
仮に初手で悪魔のキッスを使う場合、25％の確率で外した時点で確実に逃げられてしまうので期待値でわずかに劣る。
悪魔のキッスで眠らせたらヨクアタールを使う。これで次からは確実に眠らせることができる。
ドーブルの場合はキノコの胞子で確実に眠らせられる。
以降、目を覚ましたら他のあらゆる行動を差し置いて即座に眠らせること。
相手が眠ったら、まずは地球投げで体力を削る。仮に吠えられてもHP（与えたダメージ）は維持されるからだ。
3回、つまり合計120ダメージを与えたら影分身を積む。長丁場が予想されるのでじっくり6回使う。
光の粉とあわせて、吠えるの命中率は30％ほどになる。起床時に吠えるを使われる確率も考慮すれば逃げ出す確率は7.5％ほどだ。
吠える以外にも、ダメージ技をかわせる（回復の手間を減らせる）という副次的効果も大きい。
以降、眠りは絶やさないようにしてひたすらボールを投げ続ける。
HPを削った上で眠っているなら、捕獲率はおよそ6.2％ほどになるようだ。あとは運を天に任せよう。
基本的に初遭遇の時点で決定される。よって厳選するなら図鑑への事前登録は不可欠。
さすがに捕獲に手間をかけると非効率的なのでマスターボールの使用が前提となるだろう。
ちょっとした小ネタとして「図鑑を五十音順にする」というのがある。
3体とも新旧いずれの番号順よりも上に来るので、リセット後の再調査がしやすくなる。
エンテイが特に顕著だが、図鑑の空欄が詰められるのでライコウでもかなり上に来る。