アナハイム･エレクトロニクス社が７９タイプをベースに設計した機体。
本来は連邦軍のＲＧＭ−７９に変わる主力機として想定し開発された機体だと思われる。
エゥーゴは当初主力機として０６系ＭＳ(ＭＳＡ−００２)の開発をアナハイム社に依頼しておりその軍事予算を組んでいたが、実際配備された機体は７９系のこの機体であった。
｢コストパフォーマンスが悪い｣とよくいわれるのはエゥーゴ軍が本来なら安価に製造できる０６系の配備を予定していたためであったと思われる。
アナハイム社ではティターンズ崩壊後の新体制の連邦軍にこの機体の正式配備を期待していたと思われるが、連邦軍上層部の思惑や軍備縮小による予算削減などにより正式認可はされず、代わりに現行の７９Ｒにさらなる改良が加えられた｢ＲＧＭ−８６Ｒ｣及びその系列タイプが配備された。
その後アナハイム社も７９系生産ラインは８６Ｒの新製造機に切り替えられ、ＭＳＡ−００３は数種のバリエーションを残しその生涯を終えることとなった。

初出：機動戦士Ｚガンダム