Rはルビー、Sはサファイア。Eはエメラルド（基本的におまけ）を表す。再戦トレーナーについては基本的に５回戦目以降。

ポケモン 増 他の増分 出現場所/使用トレーナー 　 ポケモン 増 他の増分 出現場所/使用トレーナー
HP 　　 攻撃
マリル ２ 　 112番道路水上など グラエナ ２ 　 四天王　カゲツ
マリルリ ３ 　 浮き輪ガール　アユミ アブソル ２ 　 四天王　カゲツ
トドグラー ２ 　 四天王　プリム サメハダー ２ 　 四天王　カゲツ
オニゴーリ ２ 　 四天王　プリム ダーテング ３ 　 四天王　カゲツ
トドゼルガ ３ 　 四天王　プリム ノクタス ２ 特攻　１ 四天王　カゲツ
ゴニョニョ １ 　 カナシダトンネルなど ジュペッタ ２ 　 四天王　フヨウ
ケムッソ １ 　 トウカの森など ヤミラミ １ 防御　１ 四天王　フヨウ
キノココ １ 　 トウカの森 フライゴン １ 速さ　２ 四天王　ゲンジ
ナマケロ １ 　 トウカの森 ボーマンダ ３ 　 四天王　ゲンジ
バクオング ３ 　 ギタリスト　テリー アーマルド ２ 　 RSチャンピオン　ダイゴ
バクオング ３ （特攻　２） インタビュアー（組レアコイル）　 ドードリオ ２ 　 トライアスリート　ツヨシ/サエコ
　 　 　 　 コノハナ ２ 　 R114番道路
　 　 　 　 ザングース ２ 　 R114番道路
　 　 　 　 カゲボウズ １ 　 SEおくりび山
　 　 　 　 ワンリキー １ 　 112番道路など
防御 　　 特攻
ゴローン ２ 　 山男　ケンサク
Eマグマ団アジト		 パッチール １ 　 113番道路
ゴローニャ ３ 　 山男　ケンサク マグマッグ １ 　 E113番道路
サマヨール １ 特防　２ 四天王　フヨウ レアコイル ２ 　 トライアスリート ショウコ/ヒデアキ　
ヤミラミ １ 攻撃　１ 四天王　フヨウ ドンメル １ 　 112番道路など
コモルー ２ 　 四天王　ゲンジ コイル １ 　 ニューキンセツ
エアームド ２ 　 RSチャンピオン　ダイゴ
113番道路		 レアコイル ２ （HP　３） インタビュアー（組バクオング）
ボスゴドラ ３ 　 RSチャンピオン　ダイゴ アゲハント ３ 　 （秘密基地推奨）
メタグロス ３ 　 RSチャンピオン　ダイゴ フーディン ３ 　 サイキッカー　シホミ/カオル
サンド １ 　 113番道路など ルナトーン ２ 　 サイキッカー　シホミ
ヨマワル １ 特防　１ Rおくりび山 クサイハナ ２ 　 アロマなお姉さん　ヤヨイ
パールル １ 　 水中 ロゼリア １ 　 アロマなお姉さん　ヤヨイ
カラサリス ２ 　 トウカの森 ノクタス １ 攻撃　２ 四天王　カゲツ
マユルド ２ 　 トウカの森 　 　 　 　
特防 　　 素速さ
メノクラゲ １ 　 捨てられ船など マッスグマ ２ 　 118番道路など
お坊ちゃまミツグ/お嬢様レイカ
短パン小僧　カズキ
ドククラゲ ２ 　 捨てられ船など ジグザグマ １ 　 118番道路など
チルット １ 　 114番道路 ライボルト ２ 　 118番道路
ハスボー １ 　 SE114番道路など ラクライ １ 　 118番道路など
ハスブレロ ２ 　 SE114番道路 キャモメ １ 　 118番道路など
サマヨール ２ 防御　１ 四天王　フヨウ ズバット １ 　 RS目覚めのほこら入り口など
Eへんげの洞窟
チルタリス ２ 　 四天王　ゲンジ ゴルバット ２ 　 RS目覚めのほこら入り口など
ネンドール ２ 　 RSチャンピオン　ダイゴ　 スバメ １ 　 104番道路など
ユレイドル ２ 　 RSチャンピオン　ダイゴ オオスバメ ２ 　 短パン小僧　カズキ
ヨマワル １ 防御　１ Rおくりび山　 ヤルキモノ ２ 　 短パン小僧　カズキ
ドクケイル ３ 　 （秘密基地推奨） フライゴン ２ 攻撃　１ 四天王　ゲンジ
　 　 　 　 ビリリダマ １ 　 ニューキンセツ