フラグ成立条件つき。２回目以降のプレイにお役立てを。
赤字は、場合によっては入手し損ねるケースについての警告。
「Ｃ」に○が付いているものは、クリア後のランダム開催チャレンジカップの賞品になり得るもの。
本来の手段で入手し損ねていても、何度でも手に入れることが出来る。
「再起動」とは、セーブしてからリセットして再び始めるという意味。
| カード名 | 入手方法 | Ｃ | フラグ成立条件 |
|---|---|---|---|
| ミュウツーLv60（上半身） | ミウラ撃破後、エスパークラブサロンのおじいさんと話す | ○ | 無し（おじいさんに事前に話しかけていなくても良い） |
| ウィンディLv34 | アクアクラブサロンのお姉さんに、ラプラスを渡す | ○ | 無し |
| エレブーLv20 | エレキクラブサロンのお兄さんに、エレブーLv35を渡す | ○ | 無し |
| ピカチュウLv16（跳びポーズ） | グリーンクラブサロンの女の子に、ピッピを渡す | ○ | ナゾノクサ→ラフレシアの交換イベント成立後、再起動する |
| ピカチュウLv16（立ちポーズ） | バトルクラブサロンのおじさんに以下のカードを渡す。 パラセクト、マタドガス、ギャロップ、オムスター、ゴローン |
○ | 無し。１枚渡すごとに再起動が必要。順番はランダム？ |
| イマクニ？ | サロンに現れるイマクニ？に勝利する（３回目、６回目） | × | まずアクアクラブの女の子と話す。再戦には再起動が必要 出現するのはサイエンス、アクア、エレキ、バトルのどれか |
| プリンLv12 | ランドとの最初のバトルに勝つ。 チャンスは一度きり。負けると彼からはもらえないまま |
○ | ２枚目のメダル入手後、クラブのロビーに出現（強制イベント） |
| ミュウツーLv60（全身） | エンディング前に、最初のチャレンジカップに優勝する。 | ○ | ３枚目のメダル入手後に開催（期間限定、一度きり） |
| ヤドンLv9 | ファイアクラブサロンの男の子に、デッキに入っていない エネルギーカードを全て渡す。一度断ると二度と現れない 会話後、その部屋の本棚の左にある額縁を調べる |
○ | ３枚のメダルを入手、かつカード総数200枚以上？ エネルギーの枚数自体は関係ない模様 |
| 超エネルギー回収 | ランドとの（チャレンジ以外では）2回目のバトルに勝つ。 チャンスは一度きり。負けると彼からはもらえないまま |
○ | ５枚目のメダル入手後、クラブのロビーに出現（強制イベント） |
| ミュウLv8 | エンディング前に、2回目のチャレンジカップに優勝する | ○ | ５枚目のメダル入手後に開催（期間限定、一度きり） |
| なみのりピカチュウLv13（通常 | Mr.イシハラに、ピクシーを渡す | ○ | ３枚目のメダル入手後？ストーンクラブサロンのおばさんと話す |
| そらをとぶピカチュウLv12 | Mr.イシハラに、メタモンを渡す | × | 上の交換イベント成立後、ストーンクラブサロンのおばさんと話す |
| なみのりピカチュウLv13（富士 | Mr.イシハラに、ラッキーを渡す | ○ | 上の交換イベント成立後、ストーンクラブサロンのおばさんと話す |
| フリーザーLv37 | ポケモンドーム制覇（１回目、２回目） | × | 全てのメダルを入手する |
| サンダーLv68 | ポケモンドーム制覇（１回目、３回目） | ||
| ファイヤーLv37 | ポケモンドーム制覇（１回目、４回目） | ||
| カイリューLv41 | ポケモンドーム制覇（１回目、５回目） | ||
| フシギバナＬｖ64 | 確実な入手手段は無い。カードポン限定 | × | 不明。無いと信じたい |
| ミュウＬｖ15 |
ポケモンドーム制覇後は、カードをもらってエンディング画面（島のマップが出る）に移った時点でセーブされるのでリセットしてOK。
イシハラ関連の発生条件は不明。メダル3枚でも発生した報告あり。
期間限定イベント以外は、クリア後にまとめて行ったほうがいいかも(トレードは結構強いカードを要求されるので)。
グリーンクラブサロンの女の子は、プロモカードの交換イベントの後、リザードン→カメックスの交換を持ちかけてくる。
プロモではない通常のカードであり、他のイベントに絡むわけでもないので省いたが、必要なら交換しておくとよいだろう。
| ストーン：ゲンゾウ | 無条件。最初から戦える |
| サイエンス：クルシマ | クラブメンバーのソウタを倒す |
| エレキ：タカハシ | クラブメンバーを全て倒す |
| アクア：ウッチー | マリとメグミを倒す→シンタローを倒す。先にシンタローに話す必要はない |
| バトル：ヤマグチ | ヤマグチと会話後、クラブメンバーを全て倒す。ストーン、グリーン、ファイアにいる |
| グリーン：クニミ | クラブメンバーを全て倒し、Mr.イシハラの家へ行く |
| エスパー：ミウラ | メダルを４枚以上集める |
| ファイア：アカバネ | カードをたくさん集める（300枚？） |